Refluks można rozpoznać na podstawie typowych dla tej choroby objawów. Jeżeli objawy, pomimo leczenia, utrzymują się długo lekarz może zlecić wykonanie badań. Badania, które wykonuje się w celu diagnozy choroby refleksowej to:
1) Test z inhibitorem pompy protonowej – na podstawie obrazu klinicznego zostaje włączony lek, który zmniejsza wydzielanie soku żołądkowego. Jeżeli dochodzi do zmniejszenia się objawów, to przemawia to za refleksem.
2) Gastroskopia wraz z pobraniem wycinka ze śluzówki przełyku – jest to metoda, która pozwala ocenić przełyk, żołądek oraz dwunastnicę pacjenta. Za pomocą rury, która jest wyposażona w kamerę cyfrową oglądane są wcześniej wymienione narządy.
3) pH-metria z impedancją – polega na dwudziestoczterogodzinnym monitorowaniu przełyku.
4) Manometria przełyku – metoda ta polega na wprowadzeniu do żołądka rurki przez nos. Za pomocą tej rurki mierzy się ciśnienie górnego dolnego zwieracza przełyku.
5) Badanie endoskopowe – to badanie przełyku, żołądka i dwunastnicy.